张琳琳 研究员

海洋动物演化与环境适应
研究方向: 海洋动物演化与环境适应
岗  位: 研究员
部  门: 实验海洋生物学重点实验室
联系方式: 0532-82896651
电子邮件: linlinzhang@qdio.ac.cn
个人网页: https://linlinzhang.weebly.com/

女,博士,中国科学院海洋研究所责任研究员,从事海洋动物适应性性状的机制和应用基础研究。聚焦于生物多样性丰富的海洋冠轮动物,结合湿(实验)干(大数据挖掘)等手段,以基因表达演化驱动动物环境适应的机制为核心,从演化机制、海洋环境适应以及应用基础三个层面研究海洋动物适应性性状的分子机制和演化模式。目前开展的工作包括:1)形态性状适应性演化的基因表达调控机制;2)海洋动物对环境响应和适应的基因调控网络及其演化模式;3)海洋冠轮动物代表种基因编辑等平台的开发及其在海水养殖中的挖掘利用。迄今共发表SCI收录论文36篇,参与撰写专著一部。其中以第一(含共同)或通讯作者Nature, Nature Communications, PNAS等国际主流期刊发表论文15篇,相关研究被New York TimesThe Atlantic等著名第三方媒体报道。发表于PNAS的第一作者论文获得2017年度美国国家科学院院刊Cozzarelli奖。

教育经历

2007.09-2012.07,中国科学院海洋研究所,水产养殖学;

2003.09-2007.07,中国海洋大学,水产养殖学;

工作经历

2019年至今,中国科学院海洋研究所,实验海洋生物学重点实验室,研究员;

2017-2018,佛罗里达大学Whitney海洋生物科学研究所,博士后;

2014-2017,康奈尔大学,生态和进化生物学系,博士后;

2013-2014,霍华德-休斯医学研究所,Research Associate

2012-2013,中国科学院海洋研究所,生物技术中心,助理研究员

主持或参加主要科研项目情况

1、国家自然科学基金面上项目,海洋底栖生物小头虫再生进化的分子机制(41976088),2020/01-2023/12,主持,在研;

2、中国科学院海洋大科学研究中心重点部署项目,中国近海多毛类关键类群的分类鉴定和再生演化特征研究,2020/01-2022/12,主持,在研;

3、青岛海洋科学与技术试点国家实验室引进人才支持计划项目,海洋多毛类再生机制的研究,2019/09-2021/08,主持,在研;

4、中国科学院海洋研究所海外高层次引进人才配套启动经费,主持,在研;

发表的代表性文章(限10篇)

 

1.      Zhang, L.,Mazo-Vargas, A. & Reed R.* (2017). A single master regulatory gene coordinates the evolution and development of butterfly color and iridescence.Proceedings of the National Academy of the USA,114(40):10707-12.PNAS(Cover Story)

   Media coverage:New York Times,Nature,The atlantic,The Washington Post

2.      Zhang, L.*,Martin, A., Perry, M., van der Burg, K., Matsuoka, Y., Monteiro A.* & Reed R.* (2017). Genetic Basis of melanin pigmentation in butterfly wings.Genetics, 205(4):1537-1550.PubMed(Cover story)

3.      Huang, B.#,Zhang, L.#, Du, Y., Xu, F., Li, L.* & Zhang, G.* (2017). Characterization of the mollusc RIG-I/MAVS pathway reveals an archaic antiviral signaling framework in invertebrates.Scientific reports, 7:8217.PubMed(# co-first author)

4.      Zhang, L.& Reed R.D.* (2016). Genome editing in butterflies reveals thatspaltpromotes andDistal-lessrepresses eyespot colour patterns.Nature Communications, 7, 11769.Ncomms

Media coverage:Science News,Science Daily,EurkAlt,Newswise,Technology.org,Health Medicinet,Cornell Chronicle,Gazeta.ru,NU

5.      Huang, B.#,Zhang, L.#, Tang, X., Zhang, G., & Li, L.* (2016). Genome-wide analysis of alternative splicing provides insights into stress adaptation of the Pacific oyster. Marine Biotechnology, 18(5):598-609.Springer(# co-first author)

6.      Zhang, L., Li, L., Guo, X.*, Litman, G. W.*, Dishaw, L. J., & Zhang, G.* (2015). Massive expansion and functional divergence of innate immune genes in a protostome. Scientific Reports, 5, 8693.PubMed100 topcited, 2015

7.      Zhang, L., Li, L., Zhu, Y., Zhang, G.*, & Guo, X* (2014). Transcriptome analysis reveals a rich gene set related to innate immunity in the eastern oyster (Crassostrea virginica). Marine Biotechnology, 16(1),17-33.PubMed

8.      Zhang, G.*#, Fang, X.#, Guo, X.#, Li, L.#, Luo, R.#, Xu, F.#, Yang, P.#,Zhang, L.#, Wang, X.#, Qi, H., Xiong, Z., Que, H., Xie, Y., Holland W H, H., Paps, J., Zhu, Y., Wu, F., Chen, Y., Wang, J., Peng, C., Meng, J., Yang, L., Liu, J., Wen, B., Zhang, N., Huang, Z., Zhu, Q., Feng, Y., Mount, A., Hedgecock, D., Zhe, X., Liu, Y., Domazet Loso, T., Du, Y., Sun, X., Zhang, S., Liu, B., Cheng, P., Jiang, X., Li, J., Fan, D., Wang, W., Fu, W., Wang, T., Wang, B., Zhang, J., Peng, Z., Li, Y., Li, N., Wang, J., Cheng, M., He, Y., Tan, F., Song, X., Zheng, Q., Huang, R., Yang, H., Du, X., Chen, L., Yang, M., Gaffney, P.M., Wang, S., Luo, L., She, Z., Ming, Y., Huang, W., Zhang, S., Huang, B., Zhang, Y., Qu, T., Ni, P., Miao, G., Wang, J., Wang, Q., Steinberg, C.E.W., Wang, H., Li, N., Qian, L., Zhang, G., Li, Y., Yang, H., Liu, X., Wang., J., Yin, Y.* & Wang, J.* (2012). The oyster genome reveals stress adaptation and complexity of shell formation.Nature,490 (7418), 49-54.(# co-first author)Nature

Media coverage:Washington Post,Science News,BBC News,Science Daily,Scientific American,Fox News,Yahoo News

9.      Zhang, L., Li, L. & Zhang, G.* (2011). ACrassostrea gigasToll-like receptor and comparative analysis of TLR pathway in invertebrates.Fish & Shellfish Immunology, 30, 653-60.PubMed

10.   Zhang, L., Li, L. & Zhang, G.* (2011). Gene discovery, comparative analysis and expression profile reveal the complexity of theCrassostrea gigasapoptosis system.Developmental & Comparative Immunology,35: 603-610.PubMed

 

5年来出版的专著

1.      Zhang, L.*, & Reed R*. (2017). A practical guide to CRISPR/Cas9 genome editing in Lepidoptera.Diversity and Evolution of Butterfly Wing Patterns.

 

 

5年来申请的相关专利

1.黄宝玉,张琳琳,李莉,张国范(2015).一种长牡蛎Poly(I:C)应激实验荧光定

量的内参基因及其引物和应用. ZL 2014 1 0257711.7

获得的相关奖励

1.     美国国家科学院院刊Cozzarelli. 2018. A single master regulatory gene coordinates the evolution and development of butterfly color and iridescence,完成人:Zhang L., Mazo-Vargas, A. & Reed R.

2.     山东省自然科学二等奖. 2017.牡蛎基因组解析与潮间带适应的分子机制,排名4/5.

3.     中国海洋湖沼学会张福绥贝类学奖青年创新奖. 2019.

4.     山东省优秀博士毕业论文. 2013.

5. 中国科学院院长优秀奖. 2012.