海洋所科考船码头基地位于青岛市西海岸新区长江东路8号，作为海洋科学考察船岸基支撑平台，为“科学”号、“科学三号”、“创新二号”等科考船提供码头靠泊、船载实验设备测试维保、大型海洋调查装备堆场、船舶管理运行等支撑保障。