第一任所长 1950-1978中国科学院院士 著名海洋生物学家
第二任所长 1978-1984中国科学院院士 著名海洋生物学家
第三任所长 1984-1987中国科学院院士 著名海洋生物学家
第四-五任所长 1987-1995中国科学院院士 著名海洋地质学家
第六任所长 1995-1998海洋环境生物学家
第七-八任所长 1998-2006海洋生物学家
第九-十任所长 2006-2017海洋生物学家